Badania wykazują nierównomierny wzrost i rozprzestrzenianie wirusa w roślinach
Wirus brunatnej wyboistości owoców pomidora (ToBRFV) nie „infekuje” w równym stopniu rośliny i roślin znajdujących się w sąsiedztwie. Wirus najszybciej namnaża się w częściach roślin aktywnie rosnących. Wirusy preferują niektóre części rośliny bardziej niż inne. Taki jest wniosek z doświadczenia przeprowadzonego przez firmę Bayer z wykorzystaniem jednej z odmian gronowych, czerwonych.
Wzrost wirusa w roślinach
Wydaje się, że pomiędzy roślinami istnieją duże różnice we namnażaniu się wirusa ToBRFV. W trakcie trwania doświadczenia przyglądaliśmy się niekontrolowanej naturalnej infekcji u producenta. Poszczególne rośliny z tej samej rynny badano co 2 tygodnie, patrz wykres, metodą RT-qPCR. Najniższa wartość wirusa, którą można wiarygodnie wykryć, wynosi około Ct 32. Z tego powodu wykres zaczyna się od 32. W przypadku aktywnej infekcji wartość Ct maleje z czasem, co oznacza, że miano wirusa wzrasta.
Wykres pokazuje, że po 2 tygodniach poziom wirusa znacznie wzrasta, a w niektórych roślinach miano wirusa spada z Ct 30 do około Ct 15 (rzędy e i f). Inne rośliny nadal mają Ct w okolicach 30. Rośliny w rzędach e i f w dalszym ciągu wykazują malejące wartości Ct, osiągając Ct około 10 po 4 do 6 tygodniach.
Patrząc na wiersz b (czerwona linia), roślina ta może nie być zakażona w tygodniach:0, 2 i 4, ponieważ Ct wynosi około 30. Niski poziom wykrytego wirusa może pochodzić z zainfekowanych roślin sąsiadujących, co oznacza, że wirus leży na zewnątrz tej rośliny, ale nie doszło do infekcji. Sześć tygodni po rozpoczęciu badania wartość Ct wynosi 21, co wskazuje na obecność infekcji wirusowej, a w kolejnych tygodniach wartości Ct nadal spadają.
Grupa roślin z wczesną infekcją wykazuje silny początkowy spadek Ct w rzędach e i f (linie w kolorze niebieskim i zielonym). Wydaje się, że w tych rzędach, rośliny, które testowane były później, wykazują wolniejszy rozwój wirusa.
Pierwsze pomiary przeprowadzono pod koniec kwietnia, a 4 tygodnie później, w połowie maja, w tych roślinach wzrost wirusa wydaje się zmniejszony.
Po 4 do 10 tygodniach wszystkie rośliny stają się silnie zainfekowane, osiągając wartość Ct około 10.
Wzrost wirusa ToBRFV w roślinach w czasie. Obecność wirusa ToBRFV mierzono za pomocą RT-qPCR i wyrażano w wartościach Ct. Niższe wartości Ct oznaczają wyższe miano wirusa.
Poziom infekcji w roślinach szczepionych 2:1
Monitorowanie ToBRFV w roślinach szczepionych na 2 pędy wykazało w niektórych przypadkach dużą różnicę w stężeniu wirusa. Różnica w stężeniu wirusa sięgała w kolejnych tygodniach aż do 15 punktów Ct, obserwowano także znaczne różnice w widocznych objawach.
Było to zaskakujące, ponieważ oczekiwano, że wirus rozprzestrzeni się z jednego pędu, przez podstawę łodygi i korzenie, a następnie na drugi pęd rośliny. Wygląda na to, że 2 wierzchołki rośliny mogą być mniej lub bardziej autonomiczne. Wiadomo, że części nadziemne roślin mają „kontakt” ze swoimi „własnymi” korzeniami, ale w tym wypadku spodziewano się wystąpienia wirusa w obu pędach rośliny, ponieważ mają wspólny system korzeniowy. To tylko mały eksperyment i może nie być standardem we wszystkich przypadkach.
Rośliny pomidora badano metodą RT-qPCR pod kątem stężenia ToBRFV. Niższe wartości Ct oznaczają wyższe miano wirusa. Łodygi roślin prowadzone były na 2 różnych ścieżkach, oznaczonych jako lewa i prawa od 1 rośliny. Tydzień 0 to początek czerwca; pomiary prowadzone były co 2 tygodnie, do połowy lipca.
Obserwacje
Rośliny na tej samej macie uprawowej lub rynnie mogą mieć różne miano wirusa. Poziom wirusa może być różny pomiędzy 2 pędami rośliny szczepionej. Obie obserwacje wskazują, że korzenie prawdopodobnie nie są najważniejszą drogą przenoszenia wirusa.
Wygląda na to, że przenoszenie infekcji pomiędzy wierzchołkami roślin w tym samym rzędzie jest znacznie szybsze. Potwierdza to tezę, że dezynfekcja wózków, rękawiczek i narzędzi jest sposobem na ograniczenie rozprzestrzeniania się wirusa.
Jest to 3 artykuł z serii „Uprawa z ToBRFV:nowa rzeczywistość” firmy Bayer przygotowany przez Harmena Hummelena, field quality lead. Bądź na bieżąco. Już wkrótce ukaże się 4 artykuł na temat zapobiegania wirusom po wykryciu.