Przyczyna
Burkholderia gladioli pv. alliicola (syn. Pseudomonas gladioli pv. alliicola)
Występowanie
Cały świat
Objawy
Objawy obserwowane u roślin w uprawie polowej to często jeden lub dwa zwiędłe szczypiory pośrodku kępki. Liście te stają się z czasem jasnożółte i usychają od wierzchołka, natomiast szczypiory starsze i młodsze zachowują zdrowy wygląd i zielony kolor blaszki. We wczesnych stadiach choroby cebule mogą wyglądać na zdrowe, choć tkanka ich szyjki ulega zmiękczeniu. W przekroju podłużnym jedna lub kilka łusek wewnętrznych wyglądają na wodniste lub przypominają ugotowane. Porażenie postępuje od góry zainfekowanej łuski do podstawy, skąd może rozprzestrzeniać się na pozostałe łuski. Zakażenie nie rozprzestrzenia się też poprzecznie z łuski na łuskę. Z czasem cała tkanka wewnętrzna gnije. Na koniec łuski wewnętrzne usychają, a cebula wskutek usychania marszczy się. Naciśnięcie podstawy zainfekowanych roślin powoduje, że zgniła wewnętrzna część cebul wysuwa się przez szyjkę; stąd nazwa choroby: „miękka zgnilizna cebuli”.

Warunki rozwoju choroby
Do infekcji bakterie wymagają wilgoci, a rozwijają się w zakresie temperatur od 5 do 41°C. Ciężka infekcja może wystąpić w okresie intensywnych opadów deszczu połączonych z silnymi wiatrami lub gradem. Obfite nawadnianie i osiadająca rosa również przyczyniają się do wystąpienia choroby. Bakteria bytuje w glebie i może być szybko przenoszona na szczypior i szyjki cebuli wraz z kroplami wody, przenikając do wnętrza rośliny poprzez uszkodzenia i zranienia. W miarę rozwoju rośliny zwiększa się jej podatność na chorobę. Rośliny dojrzałe osiągają bardzo wysoki poziom podatności. W sprzyjających warunkach pogodowych (temp. 30°C), zainfekowane cebule mogą zgnić w ciągu 10 dni. Jednak w przechowalniach gnicie spowalnia. W takich warunkach proces ten prowadzący aż do całkowitego rozkładu trwa nierzadko od 1 do 3 miesięcy.
Zwalczanie miękkiej zgnilizny cebuli
Cebule należy zbierać po osiągnięciu przez nie pełnej dojrzałości. Plony należy składować w przechowalniach dopiero po dokładnym wysuszeniu cebul. Należy ograniczać do minimum uszkodzenia łodyg i cebul, a ponadto unikać zraszania w czasie, gdy zbliża się okres zbioru plonów. Takie postępowanie może ograniczyć straty w zbiorach wynikające z choroby. Cebule należy przechowywać w temperaturze 0–2°C w odpowiednio przewiewnym miejscu, co zapobiega kondensacji wilgoci na cebulach.