Onderzoek toont een ongelijke virustoename en -verdeling in planten aan

Tomato Brown Rugose Fruit Virus (ToBRFV) 'infecteert' de plant en de planten in een rij niet op dezelfde wijze. Het virus wil dáár zijn waar de actieve groeipunten zitten en wil zich daar het snelst vermenigvuldigen. Virussen geven de voorkeur aan sommige delen van de plant boven andere delen. Dit blijkt uit een experiment van Bayer met rode trostomaten.

Virustoename in planten
Er lijkt een groot verschil te zijn in de ToBRFV-toename tussen tomatenplanten. In dit experiment, hebben we gekeken naar een ongecontroleerde natuurlijke infectie op de locatie van een teler. Elke 2 weken werden van dezelfde individuele planten de kroontjes van de rode vruchten getest, zie grafiek, met de RT-qPCR-methode. De laagste hoeveelheid virus die betrouwbaar kan worden gedetecteerd ligt rond een Ct 32. De grafiek begint daarom bij 32. Bij een actieve infectie daalt de Ct-waarde in een bepaald tijdsbestek, wat betekent dat de virushoeveelheid toeneemt.

Uit de grafiek blijkt dat het virus in 2 weken sterk toeneemt, waarbij meerdere planten van Ct 30 tot rond Ct 15 gaan (rij e en f). Andere planten zitten nog steeds rond een Ct van 30. De planten in rij e en f, blijven afnemende Ct-waarde vertonen en bereiken na 4 tot 6 weken een Ct van rond de 10.

Kijkend naar plant b (de rode lijn) dan is deze plant misschien niet echt geïnfecteerd na 0, 2 of 4 weken, aangezien de Ct rond de 30 ligt. De lage virusniveaus die worden gedetecteerd, kunnen een virus zijn dat afkomstig is van naburige planten, wat betekent dat het virus aan de buitenkant van deze plant ligt, in plaats van dat het om een interne infectie gaat. Zes weken ná het begin van het testen, is de Ct 21, wat aangeeft dat er sprake is van een virusinfectie, en in de weken daarna blijven de Ct-waarden dalen.

De groep planten met een vroege infectie vertoont een sterke initiële daling, planten van rij e en f (lijnen in blauw en groen). Planten in deze rijen die later worden getest, lijken een langzamere toename van het virus te hebben.

De eerste meting was eind april en vier weken later, half mei, lijkt de virustoename afgenomen bij die planten.

Na 4 tot 10 weken zijn alle planten zwaar geïnfecteerd en bereiken een Ct-waarde van rond de 10.

2 stengels ander infectieniveau
ToBRFV monitoren in 2 stengels van 1 plant waarbij de stengels in 2 verschillende paden hangen, liet in sommige gevallen een groot verschil in virusconcentratie zien. Het verschil in virusconcentratie bedroeg in de daaropvolgende weken maximaal 15 Ct-punten en er werden ook verschillen in zichtbare symptomen waargenomen.

Dit was verrassend, omdat verwacht werd dat het virus zich van de stengel via de stengelbasis en wortels naar de andere stengel van de plant zou verspreiden. Het lijkt erop dat de twee koppen van de plant min of meer autonoom zijn. Het is bekend, dat bovengrondse plantendelen in contact staan ​​met hun ‘eigen’ wortels, maar er werd verwacht dat er virusuitwisseling zou plaatsvinden omdat het een gedeeld wortelstelsel betreft. Dit is slechts een klein experiment en het is mogelijk dat dit niet in alle gevallen standaard is.